MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4b

Total Repeats: 2183

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011991	GGC	2	6	59245	59250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109171
1002	NC_011991	GAT	2	6	59294	59299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109171
1003	NC_011991	GC	3	6	59420	59425	0 %	0 %	50 %	50 %	222109171
1004	NC_011991	TCA	2	6	59439	59444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109171
1005	NC_011991	CAC	3	9	59910	59918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109172
1006	NC_011991	CGA	2	6	60101	60106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109172
1007	NC_011991	CCCG	2	8	60180	60187	0 %	0 %	25 %	75 %	222109172
1008	NC_011991	CCCG	2	8	60218	60225	0 %	0 %	25 %	75 %	222109172
1009	NC_011991	CAA	2	6	60555	60560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222109173
1010	NC_011991	GGC	2	6	60579	60584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109173
1011	NC_011991	TC	3	6	60658	60663	0 %	50 %	0 %	50 %	222109173
1012	NC_011991	GGC	2	6	60691	60696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109173
1013	NC_011991	CAA	2	6	60764	60769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222109173
1014	NC_011991	CGC	2	6	61151	61156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109174
1015	NC_011991	CGC	2	6	61201	61206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109174
1016	NC_011991	GAGAT	2	10	61233	61242	40 %	20 %	40 %	0 %	222109174
1017	NC_011991	GAT	2	6	61249	61254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109174
1018	NC_011991	CAT	2	6	61306	61311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109174
1019	NC_011991	GCC	2	6	61317	61322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109174
1020	NC_011991	GTC	2	6	61926	61931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109175
1021	NC_011991	GTCT	2	8	61952	61959	0 %	50 %	25 %	25 %	222109175
1022	NC_011991	CTT	2	6	62019	62024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109175
1023	NC_011991	TGCC	2	8	62047	62054	0 %	25 %	25 %	50 %	222109175
1024	NC_011991	C	6	6	62053	62058	0 %	0 %	0 %	100 %	222109175
1025	NC_011991	AAC	2	6	62102	62107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222109175
1026	NC_011991	ATA	2	6	62128	62133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222109175
1027	NC_011991	GGTC	2	8	62154	62161	0 %	25 %	50 %	25 %	222109175
1028	NC_011991	AGCA	2	8	62188	62195	50 %	0 %	25 %	25 %	222109175
1029	NC_011991	TCGG	2	8	62246	62253	0 %	25 %	50 %	25 %	222109175
1030	NC_011991	GGGC	2	8	62312	62319	0 %	0 %	75 %	25 %	222109176
1031	NC_011991	TCGCT	2	10	62344	62353	0 %	40 %	20 %	40 %	222109176
1032	NC_011991	TCC	2	6	62393	62398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222109176
1033	NC_011991	TC	3	6	62507	62512	0 %	50 %	0 %	50 %	222109176
1034	NC_011991	CCA	2	6	62564	62569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109176
1035	NC_011991	GCCG	2	8	62752	62759	0 %	0 %	50 %	50 %	222109177
1036	NC_011991	CGG	2	6	62807	62812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109177
1037	NC_011991	ATAG	2	8	62815	62822	50 %	25 %	25 %	0 %	222109177
1038	NC_011991	CGCAG	2	10	62829	62838	20 %	0 %	40 %	40 %	222109177
1039	NC_011991	CGG	2	6	62839	62844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109177
1040	NC_011991	TCG	2	6	62870	62875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109177
1041	NC_011991	GTC	2	6	62993	62998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109177
1042	NC_011991	CGGTAT	2	12	63027	63038	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222109177
1043	NC_011991	CCG	2	6	63045	63050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109177
1044	NC_011991	GTCGC	2	10	63089	63098	0 %	20 %	40 %	40 %	222109177
1045	NC_011991	CCG	2	6	63101	63106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109177
1046	NC_011991	GAT	2	6	63190	63195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109177
1047	NC_011991	GCC	2	6	63215	63220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109177
1048	NC_011991	GAAG	2	8	63228	63235	50 %	0 %	50 %	0 %	222109177
1049	NC_011991	GAT	2	6	63315	63320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109177
1050	NC_011991	TGG	2	6	63447	63452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222109177
1051	NC_011991	TGA	2	6	63492	63497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109177
1052	NC_011991	TC	3	6	63510	63515	0 %	50 %	0 %	50 %	222109177
1053	NC_011991	CGA	2	6	63526	63531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109177
1054	NC_011991	CTT	2	6	63556	63561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109177
1055	NC_011991	GTC	2	6	63649	63654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109177
1056	NC_011991	CCG	2	6	63696	63701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109177
1057	NC_011991	GCT	2	6	63708	63713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109177
1058	NC_011991	CGG	2	6	63714	63719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109177
1059	NC_011991	GTC	2	6	63733	63738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109177
1060	NC_011991	CG	3	6	63753	63758	0 %	0 %	50 %	50 %	222109177
1061	NC_011991	TCA	2	6	63768	63773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109177
1062	NC_011991	CCT	2	6	63882	63887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222109177
1063	NC_011991	GCC	2	6	64006	64011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109177
1064	NC_011991	AGG	2	6	64064	64069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222109177
1065	NC_011991	GCC	2	6	64078	64083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109177
1066	NC_011991	CGA	2	6	64103	64108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109177
1067	NC_011991	AACC	2	8	64116	64123	50 %	0 %	0 %	50 %	222109177
1068	NC_011991	CGG	2	6	64180	64185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109177
1069	NC_011991	GCG	2	6	64196	64201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109177
1070	NC_011991	AAG	2	6	64325	64330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109177
1071	NC_011991	AGA	2	6	64376	64381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109177
1072	NC_011991	TGGC	2	8	64387	64394	0 %	25 %	50 %	25 %	222109177
1073	NC_011991	CAC	2	6	64425	64430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109177
1074	NC_011991	A	6	6	64451	64456	100 %	0 %	0 %	0 %	222109177
1075	NC_011991	C	6	6	64470	64475	0 %	0 %	0 %	100 %	222109177
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1081	NC_011991	ACC	2	6	64833	64838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109178
1082	NC_011991	TCT	2	6	64855	64860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109178
1083	NC_011991	CG	3	6	64861	64866	0 %	0 %	50 %	50 %	222109178
1084	NC_011991	CGT	2	6	64938	64943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109179
1085	NC_011991	CGA	2	6	64956	64961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109179
1086	NC_011991	GCGA	2	8	65047	65054	25 %	0 %	50 %	25 %	222109179
1087	NC_011991	CG	3	6	65072	65077	0 %	0 %	50 %	50 %	222109179
1088	NC_011991	CT	3	6	65363	65368	0 %	50 %	0 %	50 %	222109180
1089	NC_011991	C	6	6	65387	65392	0 %	0 %	0 %	100 %	222109180
1090	NC_011991	ATC	2	6	65395	65400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109180
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1092	NC_011991	GAGGG	2	10	65473	65482	20 %	0 %	80 %	0 %	222109180
1093	NC_011991	CTT	2	6	65490	65495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109180
1094	NC_011991	CAA	2	6	65496	65501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222109180
1095	NC_011991	TGA	2	6	65561	65566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109180
1096	NC_011991	ATC	2	6	65589	65594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109180
1097	NC_011991	GAT	2	6	65706	65711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109180
1098	NC_011991	TCC	2	6	65725	65730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222109180
1099	NC_011991	GC	3	6	65740	65745	0 %	0 %	50 %	50 %	222109180
1100	NC_011991	TGA	2	6	65801	65806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109180
1101	NC_011991	AAG	2	6	65845	65850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109180
1102	NC_011991	AACA	2	8	65974	65981	75 %	0 %	0 %	25 %	222109180
1103	NC_011991	CGC	2	6	66056	66061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109180
1104	NC_011991	GAGGCG	2	12	66094	66105	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	222109180
1105	NC_011991	CG	3	6	66165	66170	0 %	0 %	50 %	50 %	222109180
1106	NC_011991	AGC	2	6	66179	66184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109180
1107	NC_011991	CGA	2	6	66231	66236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109180
1108	NC_011991	TGA	2	6	66270	66275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109180
1109	NC_011991	GAG	2	6	66343	66348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222109180
1110	NC_011991	GCC	2	6	66437	66442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109180
1111	NC_011991	CG	3	6	66479	66484	0 %	0 %	50 %	50 %	222109180
1112	NC_011991	GCC	2	6	66496	66501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109180
1113	NC_011991	CGA	2	6	66516	66521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109180
1114	NC_011991	CGA	2	6	66552	66557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109180
1115	NC_011991	GTC	2	6	66571	66576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109180
1116	NC_011991	ATG	2	6	66604	66609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109180
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1118	NC_011991	GCG	2	6	66656	66661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109180
1119	NC_011991	GGC	2	6	66675	66680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109180
1120	NC_011991	CCT	2	6	66725	66730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222109180
1121	NC_011991	AGG	2	6	66746	66751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222109180
1122	NC_011991	CGA	2	6	66789	66794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109180
1123	NC_011991	GTCGC	2	10	66805	66814	0 %	20 %	40 %	40 %	222109180
1124	NC_011991	ATCG	2	8	66841	66848	25 %	25 %	25 %	25 %	222109180
1125	NC_011991	CTTGTC	2	12	66862	66873	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	222109180
1126	NC_011991	GGCG	2	8	66903	66910	0 %	0 %	75 %	25 %	222109180
1127	NC_011991	ACA	2	6	66932	66937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222109180
1128	NC_011991	GCGCCA	2	12	66966	66977	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222109180
1129	NC_011991	GC	3	6	67009	67014	0 %	0 %	50 %	50 %	222109180
1130	NC_011991	GAAG	2	8	67062	67069	50 %	0 %	50 %	0 %	222109180
1131	NC_011991	ACC	2	6	67072	67077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109180
1132	NC_011991	CGC	2	6	67092	67097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109180
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1134	NC_011991	CAT	2	6	67218	67223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109180
1135	NC_011991	CGT	2	6	67341	67346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109180
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1205	NC_011991	CCACA	2	10	70686	70695	40 %	0 %	0 %	60 %	222109182
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1226	NC_011991	CAA	2	6	72126	72131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222109183
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1228	NC_011991	CCGAA	2	10	72176	72185	40 %	0 %	20 %	40 %	222109183
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1231	NC_011991	GGTGTC	7	42	72649	72690	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	222109184
1232	NC_011991	CG	4	8	72712	72719	0 %	0 %	50 %	50 %	222109184
1233	NC_011991	ATC	2	6	72751	72756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109184
1234	NC_011991	CGAA	2	8	72771	72778	50 %	0 %	25 %	25 %	222109184
1235	NC_011991	CGC	2	6	72837	72842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109184
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1237	NC_011991	CG	4	8	72860	72867	0 %	0 %	50 %	50 %	222109184
1238	NC_011991	TC	3	6	72912	72917	0 %	50 %	0 %	50 %	222109184
1239	NC_011991	GAGC	2	8	72993	73000	25 %	0 %	50 %	25 %	222109184
1240	NC_011991	ACA	2	6	73014	73019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222109184
1241	NC_011991	ATTA	2	8	73515	73522	50 %	50 %	0 %	0 %	222109185
1242	NC_011991	AGAA	2	8	73664	73671	75 %	0 %	25 %	0 %	222109185
1243	NC_011991	TCG	2	6	73685	73690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109185
1244	NC_011991	CGA	2	6	73754	73759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109186
1245	NC_011991	CAG	2	6	73797	73802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109186
1246	NC_011991	AGCC	2	8	73948	73955	25 %	0 %	25 %	50 %	222109186
1247	NC_011991	GT	3	6	74026	74031	0 %	50 %	50 %	0 %	222109186
1248	NC_011991	GGC	2	6	74463	74468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109187
1249	NC_011991	TTCGT	2	10	74552	74561	0 %	60 %	20 %	20 %	222109187
1250	NC_011991	GCA	2	6	74577	74582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109187
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1252	NC_011991	ACA	2	6	74667	74672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222109187
1253	NC_011991	CCA	2	6	74681	74686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109187
1254	NC_011991	AAT	2	6	74805	74810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222109187
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1257	NC_011991	CG	3	6	74981	74986	0 %	0 %	50 %	50 %	222109187
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1380	NC_011991	TTC	2	6	82029	82034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109193
1381	NC_011991	TGCGTG	2	12	82505	82516	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	222109194
1382	NC_011991	TTG	2	6	82517	82522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222109194
1383	NC_011991	AGGA	2	8	82532	82539	50 %	0 %	50 %	0 %	222109194
1384	NC_011991	CG	3	6	82557	82562	0 %	0 %	50 %	50 %	222109194
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1499	NC_011991	GTTC	2	8	90546	90553	0 %	50 %	25 %	25 %	222109202
1500	NC_011991	TAG	2	6	90634	90639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109202

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